产品概述
ATAC测序的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing,运用测序手段研究转座酶可靠近的染色质的一种手艺 。该手艺通过转座酶对某种特准时空下开放的核染色质区域举行切割 ，进而获得在该特准时空下基因组中活跃转录的调控序列 。这项手艺仅需少量细胞便可获得实时全基因组活性调控序列信息 ，应用于转录因子团结剖析、核小体定位、活性调控元件漫衍等研究 ，在表观遗传机制研究领域有辽阔的应用远景 。
测序流程
ATAC-seq主要实验流程首先是制备细胞悬液 ，然后裂解液裂解细胞获得细胞核 ，进一步使用Tn5转座酶酶切并纯化 ，最后接纳DNA片断 ，对接纳片断举行最后修复、3’端加A、毗连测序讨论 ，片断巨细选择以及PCA扩增等办法获得标准的高通量测序文库 ，使用Illumina测序平台举行测序 。
剖析流程
原始测序Reads经已往讨论和过滤低质量 ，获得Clean Reads 。将Clean Reads与参考基因组序枚举行比对 ，通过Reads在基因组上的比对位置信息 ，举行Peak calling ，并举行motif展望、转录因子靶基因挖掘、差别Peak和Motif中剖析 。
效果展示
开放染色质区域可视化图
转录起始位点周围的开放染色质区域
差别开放染色质区域聚类热图
样本要求
动物组织（包括真菌）、植物组织（包括藻类）、冻存的细胞样品（基本笼罩所有物种） 。
a) 细胞：>1×106
b) 动物组织：>50 mg
c) 植物组织：>500 mg
提供更好的效劳
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西安本土标准化实验室,真实可靠的效果
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测序准确性高,原始数据质量高
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权威专家&顶尖生信团队&最合适的剖析工具
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项目履历富厚,一对一定制化个性效劳
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交互性基因深度挖掘,最新的多组学团结剖析计划