产品概述
空间转录组是从空间层面上剖析RNA-seq数据的手艺，从而剖析单个组织切片中的所有mRNA，从而能够定位和区分功效基因在特定组织区域内的活跃表达。细胞在组织内的物理位置是决议其分子特征的要害因素。
应用偏向
肿瘤学：肿瘤微情形；肿瘤异质性；疾病希望；肿瘤形态；肿瘤浸润淋巴细胞
免疫学：免疫细胞浸润；免疫细胞表达特征；免疫群体的扩散
生长发育：器官发育图谱；发明组织配景与形态形成有关的基因
神经科学：绘制大脑各个细胞层；区分正常和患病大脑的剖解特征
病理学：增添基因表达信息判断形态学结论
手艺原理
1、对新鲜冷冻组织举行切片，并举行成像。
2、将组织切片安排在含有与RNA团结捕获探针的载玻片上，并举行牢靠和透化（使细胞中的mRNA获得释放，并团结到响应的捕获探针上，从而获取基因表达信息）。
3、以捕获的RNA为模板举行cDNA合成和测序文库制备。
4、对制备好的文库举行测序。
5、数据可视化剖析（确定哪些基因获得表达，基因表达量，以及这些基因的空间位置信息）。
手艺特点
通太过析统一组织切片的组织学特征和 mRNA空间表达情形，可以发明新的组织生物标记物；
通过转录组剖析，可以展现新发明的细胞盛行、细胞状态和生物标记物的空间排布；
通过于预先设计的靶基因组合，可以验证之前发明的效果，或关注所有与靶基因相关的基因；
剖析生物学结构，并相识正常组织和病理组织中细胞之间的空间关系；
剖析并相识基因表达的空间异质性，等等。
小鼠肾脏空间转录组的mRNA表达及聚类
A代表组织切片的HE染色。B和C划分代表UMI计数和总基因计数与组织空间位置的图像叠加。D代表基于总体差别表达基因的空间聚类效果，最右边显示了cluster2排名前10的特异表达基因。E、F、G、H划分代表了差别基因的空间mRNA表达。
小鼠大脑空间区分率的基因表达
A代表组织切片的HE染色。B和C划分代表海马组织的标记基因Tmsb4x和Selenow基因的空间表达情形，效果显示这两个基因在海马体中显著高表达，切合已知的基因表达模式
样本类型
人：脑、乳腺、乳腺*、心脏、肾脏、大肠、肺、肺*、淋投合、卵巢、脾、脊髓
小鼠：脑、眼睛、心脏、肾脏、大肠、肝、肺、嗅球、卵巢、四头肌、小肠、脾、胃、睾丸、甲状腺、舌
大鼠：脑、心脏、肾脏、嗅球
样本要求
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样品份数：关于统一泉源的样品，云序生物建议寄送3份，其中一份用于通例 RNA 提取质检，一份用于现实的空间转录组实验，一份留作备用。
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样品量：每份样品须小于?6.5mm?x 6.5mm x 6.5mm，相当于约莫一颗绿豆巨细。请勿提供过大或过小的样品，由于样品过上将造成制片难题，无法在简单矩形捕获区域中涵盖整个样品切片；样品过小将造成捕获区域的铺张，且可能导致通例RNA 质检用量缺乏。
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样本运输与珍藏：因新鲜组织运送要求高，建议客户做到冷冻组织-OCT 包埋后干冰运运送样。
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