菌种判断一样平常就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16s rDNA片断,上机测序之后,上GeneBank或者Eztaxon比照即可。一样平常序列相似度在99%以上就可以以为是统一个种细菌(虽然也有破例,DNA序列仅仅是一个参考指标)。
通例判断内容有形态特征和理化特征。形态特征包括显微形态和作育特征;理化特征包括营养类型、碳氮源使用能力、种种代谢反应、酶反应和血清学反应等。
rDNA(核糖体DNA)序列剖析、功效基因剖析、心理生化剖析、API、形态学剖析、G+Cmol%含量测定、脂肪酸组分剖析、DNA-DNA杂交、极性脂、呼吸醌等。
细菌、放线菌、酵母、霉菌、正规丝状真菌、乳杆菌、双歧杆菌、肠球菌、芽孢杆菌、青霉菌等。
包括形态学视察、心理生化特征判断、BIOLOG碳源自动剖析判断、分子生物学判断、API细菌数值判断、功效性剖析及功效基因、RAPD、SSCP、TLC薄层层析、全细胞脂肪酸剖析判断、(G+C)mol%测定、DNA/DNA同源性测定等。
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